El Gabinete se subdivide en varios departamentos que se ocupan de estudiar disciplinas como la arqueología, la pintura mural, la bioarqueología, la investigación histórica y la conservación, restauración y museología de evidencias materiales procedentes de excavaciones. El Gabinete acoge, además, un museo arqueológico que exhibe importantes colecciones.
Cuenta con una biblioteca especializada en arqueología aborigen e histórica de Cuba, cuyo fondo reúne textos de temas específicos como cerámica y vidrio arqueológico, arqueología de la arquitectura, conservación y restauración de bienes culturales y pintura mural. En ella se pueden consultar las investigaciones realizadas por el personal técnico de la institución.
Objetivo:
Fomentar el desarrollo de las investigaciones arqueológicas e históricas, que desde 1968 se realizan en La Habana Vieja por parte de la Oficina del Historiador, dentro del Plan de Rehabilitación Integral del Centro Histórico de la capital cubana.